益生菌能在抗生素后恢复肠道吗？证据

在使用抗生素期间服用益生菌，可能有助于一些人避免腹泻，但这与恢复肠道微生物组是不同的主张。就恢复而言，现有最佳分子证据并未得出补充剂营销所暗示的结果：一项2024年系统综述中的随机试验，没有任何一项使参与者的微生物组恢复至抗生素使用前的基线。

担忧并不止于获益不确定。一项2025年实验室研究在六种商业益生菌补充剂中发现了抗生素耐药基因，并表明部分耐药基因可在人体肠道细胞系表面转移至受体细菌。该实验并未告诉我们这种转移在活人体内发生的频率。但它确立了一个值得认真对待的、合理的安全性问题，尤其是在暴露于抗生素期间。

“恢复你的肠道”是远超证据支持范围的承诺

Łukasik等人于2024年发表的系统综述聚焦于采用16S rRNA测序或宏基因组鸟枪法测序的随机对照试验；这些方法能够测量微生物组组成的广泛变化。该综述仅发现7项试验，发表于8篇论文中。这对于常规联合开具益生菌而言，是相当薄弱的基础。

结果也并未指向同一个令人安心的方向。一项研究发现益生菌抵消了抗生素相关的多样性丧失。一项研究发现菌群失调更严重，且微生物组恢复延迟。4项研究发现益生菌对微生物组组成或多样性没有可检测到的影响。该综述还发现一项研究显示益生菌对抗生素耐药基因没有影响，另一项研究则显示使用益生菌后耐药基因净增加。

最重要的是，7项试验中没有任何一项显示微生物组组成或多样性恢复至抗生素使用前的基线。各试验的异质性过高，无法进行荟萃分析，因此没有关于获益或危害的合并效应估计。该综述因此未推荐用于微生物组恢复的特定益生菌。

这并不能证明每一种益生菌都无效。不同菌株、抗生素、剂量、饮食和宿主微生物组可能产生不同结果。但这意味着，“服用益生菌以恢复肠道”这一说法超出了证据范围。现有基于测序的试验尚未显示这一结局。

商业益生菌可能携带耐药基因

Tian等人于2025年发表的研究采用PCR检测法筛查了六种商业益生菌补充剂中的抗生素耐药基因。全部六种产品均含有四环素耐药基因，其中tet(K)最常见。产品还携带与大环内酯类、氨基糖苷类和糖肽类耐药相关的基因。耐药基因负担最高的产品在这些药物类别中含有12种不同的耐药基因。

仅检测到这些基因，并不意味着服用益生菌的人会发生耐药性感染。基因在是否为物种固有、获得性、可移动、表达或可转移方面各不相同。尽管如此，获得性和可转移的耐药基因很重要，因为肠道微生物可以交换DNA。人体肠道是一个密集的微生物生态系统，而不是一个密封的补充剂货架。

基因组层面的研究支持这一更广泛的担忧。Fatahi-Bafghi等人于2022年发表的研究通过基因组分析在益生菌菌株中鉴定出抗生素耐药基因，这种方法可与PCR筛查互补。Crits-Christoph等人于2022年发表的一篇综述描述了肠道耐药组为何可充当动态储库：可移动遗传元件、抗生素选择压力以及现有微生物群落，都会影响耐药基因是否持续存在或传播。

抗生素产生选择压力

Tian及其同事所做的不只是检测产品成分。他们证明，在Caco-2和HCT-116肠道细胞系表面，链霉素耐药基因可通过接合转移从适应性益生菌菌株转移至代表性受体细菌。这比简单的滤膜接合试验与肠道环境更相关，但仍然是一种体外模型。

同一项研究发现，在10个适应性进化循环中，与野生型菌株相比，链霉素适应性益生菌菌株对其他类别抗生素的耐受性获得得更快。红霉素耐受性达到野生型水平的4倍，四环素耐受性达到8倍，而适应性菌株中出现了对多西环素的耐药性，野生型菌株则仍然敏感。

这一结果使联合处方的逻辑令人不安。抗生素会选择出耐药细菌。如果引入的益生菌已经携带耐药基因，或可在选择压力下适应，那么在一个疗程的抗生素期间服用它，可能创造有利于耐药性的条件，而非仅仅提供“好细菌”。

但其临床影响程度仍未知。该研究并未确定转移在完整人体肠道中发生的频率、转移后的基因是否持续存在，或它们是否导致感染或治疗失败。既有肠道群落、胆汁酸、免疫活性、肠道转运时间以及微生物之间的竞争，都可能改变转移和持续存在的情况。一项细胞系实验表明的是可能性，而不是人体风险百分比。

监管可以减少这一问题，但覆盖范围有限

欧洲提供了一个有用的概念验证。欧洲食品安全局的合格安全推定框架要求提供证据，证明有意引入欧盟食品链的细菌不含获得性抗生素耐药基因；自2018年起，已要求进行全基因组序列验证。EFSA还对相关生物体采用表型耐药性阈值，包括链霉素、四环素和红霉素的上限阈值。

Rozman等人于2022年发表的研究得出结论，在该框架下有意引入农食产业链的乳酸菌和双歧杆菌，并未显著增加总体抗微生物药物耐药基因库。这是一个有意义的反证：筛查可以形成更安全的一类菌株。

这并不是对所有益生菌的一揽子安全认证。QPS的发现适用于欧盟食品链中经EFSA筛查的菌株，并不自动适用于其他地区销售的补充剂产品。消费者通常无法核查某个特定非处方产品是否经过全基因组耐药性筛查，因为制造商并不常规公布这些数据。

为何新生儿研究结果不能解决成人问题

新生儿研究中存在有限且不一致的信号。Fernandes等人于2024年发表的系统综述确定了6项关于益生菌和抗生素耐药性结局的新生儿研究：2项报告了有利效果，1项报告了不利效果，3项报告没有显著效果。

这些数据不应被轻易忽视，但它们同样不能确立益生菌对接受常规抗生素治疗的健康成人有益。早产儿的微生物组尚不成熟、多样性较低，并且常常经历与社区成人照护显著不同的医院暴露。该综述的异质性使得一个简单平均值无法回答哪些菌株对哪些人有帮助，或风险有多大。Ojeda等人于2024年发表的研究还发现，早产儿早期使用抗生素与耐药基因丰度增加相关，这进一步表明新生儿耐药组生物学具有其自身的临床背景。

如何看待这些信息

如果临床医生建议使用特定益生菌预防抗生素相关性腹泻，应询问该产品针对什么结局，以及有哪些证据支持该菌株适用于你的情况。不要假定答案是恢复微生物组。对于其他方面健康的成人，分子层面的随机试验证据并不支持这一主张。

对于只是想在抗生素疗程期间及之后正常饮食的人，如果发酵食品适合你，它们是合理的食物选择。它们并非经证实可替代补充剂，也没有直接随机比较证实它们能降低抗生素使用期间的耐药基因风险。

在使用抗生素期间常规联合开具益生菌，尚未被证明能将微生物组恢复至抗生素使用前状态；而商业产品可能携带耐药基因，且在实验室肠道模型中已显示具有转移潜力。人体风险仍未量化，但营销上的确定性并无正当依据。